Το πρόγραμμα του Σαββατοκύριακου στις ακαδημίες του ΑΠΣ Ατρόμητου έχει ως εξής:
ΣΑΒΒΑΤΟ
ΑΤΡ. 2006-2007 - ΚΗΠΟΥΠΟΛΗ 9.15
ΑΤΡ. 2003 - ΠΑΝΙΩΝΙΟΣ 9.30 (ΑΓ. ΚΟΣΜΑΣ)
ΑΤΡ. 2006-2007 - ΝΕΤ ΙΛΙΟΥ 10.15
ΑΣΤΕΡΑΚΙΑ - ΝΕΤ. ΙΛΙΟΥ 10.15
ΑΤΡ. 2001 - ΠΑΝΙΩΝΙΟΣ 10.45 (ΑΓ. ΚΟΣΜΑΣ)
ΑΤΡ. 2004 - ΑΕΚ 11.15
ΑΤΡ. 2004 - ΜΙΛΤΙΑΔΗΣ 12.15
ΑΤΡ. 2002 - ΠΑΣ ΓΑΛΑΤΣΙ 13.15
ΑΤΡ. 2003 - ΗΦΑΙΣΤΟΣ 14.30
ΑΤΡ. 2001 - ΓΙΟΥΒΕΝΤΟΥΣ 15.30
ΑΤΡ. 2005 - ΑΠΟΛΛΩΝ 19.00 (ΧΩΡΑΦΑ)
ΑΤΡ. 2000 - ΧΡΥΣΟΥΠΟΛΗ 19.30
ΚΥΡΙΑΚΗ
ΑΤΡ. 2002 - ΠΑΣ ΓΙΑΝΝΙΝΑ 9.45 (ΚΑΡΟΥΛΙΑ)
ΑΤΡ. 2002 - ΚΟΛΩΝΟΣ 12.45
ΑΤΡ. 2004 - ΑΓ. ΑΝΑΡΓΥΡΟΙ 13.15 (ΑΓ. ΑΝΑΡΓΥΡΩΝ)
ΑΤΡ.1999 - Κ.17 14.00
ΑΤΡ. 2001 - ΑΓ. ΑΝΑΡΓΥΡΟΙ 14.15
ΑΤΡ.2003 - ΗΦΑΙΣΤΟΣ 15.30
ΑΤΡ.2003 - ΗΦΑΙΣΤΟΣ 16.45
ΑΤΡ.2006-2007 - ΟΛ.ΛΙΟΣΙΩΝ 18.00
ΑΤΡ.2006-2007 - ΔΗΜΟΣ ΠΕΤΡ. 18.00
ΑΤΡ.2004-2005 - ΗΡΑΚΛΗΣ 19.00
ΑΤΡ.2005- 2006 - ΗΡΑΚΛΗΣ 20.00