Στην κλήρωση θα συμμετάσχουν οι εννέα ομάδες της Α’ Κατηγορίας και οι επτά της Β’ Κατηγορίας που προκρίθηκαν από την 2η φάση.

Για τους αγώνες της 3ης φάσης, οι συμμετέχουσες ομάδες θα χωριστούν σε δύο ομίλους ως εξής:

 1ος Όμιλος: ΑΕΛ, Ελπίδες Καρδίτσας, Αμαζόνες Δράμας, Άρης, Μέντεκας, ΠΑΟΚ, Προοδευτική Περάματος, Τρίκαλα.

 2ος Όμιλος: Αβάντες Χαλκίδας, Αγία Παρασκευή, Άρης Κορίνθου, Ατρόμητος, Γλυφάδα, Ολυμπιάδα Υμηττού, Πανηλειακός, Φείδων Άργους.

 Σε κάθε όμιλο θα διεξαχθούν τέσσερις απλοί αγώνες (νοκ άουτ) στην έδρα της ομάδας που θα κληρωθεί πρώτη. Στις περιπτώσεις που κληρωθεί ομάδα Α’ Κατηγορίας με ομάδα Β’ Κατηγορίας, ο αγώνας θα διεξαχθεί στην έδρα της ομάδας Β’ Κατηγορίας.