32 ομάδες θα μπουν στη κλήρωση ώστε να δημιουργηθούν οι όμιλοι του Κυπέλλου. Αυτές οι 32 θα χωριστούν σε τέσσερα γκρουπ δυναμικότητας. Στο πρώτο θα βρίσκονται οι 8 πρώτες ομάδες της περσινής Super League, στο δεύτερο οι ομάδες από το 9 έως το 14 συν τις δύο που ανέβηκαν, στο τρίτο οι 7 πρώτες ομάδες της Football League, χωρίς τους Άρη, ΟΦΗ και συν την Κέρκυρα και στο τέταρτο γκρουπ θα βρεθούν οι υπόλοιπες 8 ομάδες.
Κάπως έτσι τα γκρουπ δυναμικότητας θα είναι τα εξής:
2ο ΓΚΡΟΥΠ: ΠΑΣ Γιάννινα, Λεβαδειακός, Παναθηναϊκός, ΑΕΛ, Λαμία, Απόλλων Σμύρνης, ΟΦΗ, Άρης.
3ο ΓΚΟΥΠ: Κέρκυρα, Παναχαϊκή, ΑΟΧ Κισσαμικός, Τρίκαλα, Απόλλων Πόντου, Απόλλων Λάρισας, Εργοτέλης, Ηρακλής.
4ο ΓΚΡΟΥΠ: Ηρόδοτος, Βόλος, Αήττητος Σπάτων, Νίκη Βόλου, Άρης Αβάτου, ΟΦ Ιεράπετρας, Απόλλων Παραλιμνίου, Θύελλα Καμαρίου.
Το σύστημα διεξαγωγής των αγώνων της 4ης Φάσης, διασφαλίζει ρητώς ότι οι ομάδες της Super League θα δώσουν δύο (2) αγώνες εκτός έδρας και έναν (1) εντός έδρας, και οι υπόλοιπες ομάδες θα δώσουν δύο (2) αγώνες εντός έδρας και έναν (1) αγώνα εκτός έδρας, με τον εξής κλειδάριθμο:
1η Αγωνιστική: 1Χ2 - 4Χ3
2η Αγωνιστική: 3Χ1 - 2Χ4
3η Αγωνιστική: 3Χ2 - 4Χ1
Οι αγώνες των ομίλων θα είναι μονοί και θα ολοκληρωθούν σε διαδικασία τριών (3) αγωνιστικών ημερών.
Προκρίνονται στην 5η Φάση οι δύο πρώτες ομάδες της τελικής κατάταξης κάθε ομίλου.